天地初成，由混沌中分出了阴阳，久而生成道体，道体化为灵山，为抵御天劫而布下九重天境，对应天九之数形成九界。九界依据自身特性，得名如下：朔金界、震雷界、厚土界、蜃沙界、离火界、元木界、柔水界、虚风界、空明界，各不相干自成一统。无数劫后，各界又孕育出不同的生灵，其中各界的大族依次为：源石族、御风族、人族、七虫族、炎焱族、栖绵族、蕴水族、凤羽族、千灵族。
九界生灵依据其本性，开始修真。最早摆脱九界束缚的是一个千灵族人，后来通过修习他撰写的《阴阳道鉴》，众多修真者度过天劫得以成仙，于是尊称其为九界道祖。九界道祖意识到神域的存在，为了修神转世厚土界重新修行，是为道一真人。道一真人追求的是一种极致力量，引发了继任的仙界之主木临风的担忧，进而引发了修行理念的争执，仙界分为了两大流派。感知到灵山所在，道一真人和七虫大帝私自闯入灵山，阴阳平衡被打破，灵山爆裂九界坍塌。
木临风率众仙布下万仙大阵，虽然保住了厚土界，但是厚土界也已是面目全非。灵山的一块碎片坠落在厚土界，形成了后世的须弥山，须弥山内藏天地灵气，不过却被万仙大阵所包裹，世人无缘得知。木临风对厚土界残存的各族修真者重新厘定，建悬空岛作为九界道祖的道场，随后返回仙界。而九界众生在经过一段适应过程后，开始有所接触。
人族作为厚土界的原住势力，此时最为强大，虽然没有感知到须弥山的玄机，但是大衍王朝还是将须弥山作为禁地看管起来。在须弥山上流下的横水中发现了久违的灵气，为保证本族的繁衍生息，凤羽族羽幽部落族长羽农，运用一种神奇的覆魂术控制了大衍国大将铁梁，盗取了倚刚山源石族的石魂，直接引发了源石族和大衍国的战争。
大衍国以天机门法宝静阴符为条件，换取栖绵族出兵相助。栖绵族大军北上过天堑山脉，经西岭戈壁到达夕州，在此击退了攻击浮云颠的源石族，并一路打到倚刚山下。与此同时，被流放的铁梁，受到砂精和冰精的狙杀，被蕴水族修真者所救。蕴水族族长流千川从中敏锐地觉察到羽农的阴谋，经过一番打探，了解到须弥山内藏玄机，于是也卷入到对须弥山的争夺之中。
随着战事的扩大，千灵族几番调停未果，通过法阵向木临风禀告了厚土界的战乱。于是妖仙狐晏下凡，很快查明真相，将罪魁祸首羽农禁制在落幕峡，随后将源石族丢失的石魂还给了拓山，平息了战乱。不料变故横生，狐晏与铁梁祖先有莫大的渊源，为了铁梁严加斥责大衍国，继而又开始打压栖绵族。魔界密使毒蛟道人，以诡门长老的身份，不断诱惑狐晏统领世间，狐晏的私欲逐渐膨胀，最终自立为原界之主，号帝君。
原界帝君即位之初，以武力征服四方。蕴水族流千川，率先挑起了对大衍国的攻击。狐晏亲自出手，逼迫御风族在天堑山脉一带，伏击了天机门宗主无机上人一行，无机上人殒命，叶行天大恸而亡，大衍国皇位传于皇长子叶衷渔。另一方面，由于炎焱族不肯归服，狐晏命凤羽族、蕴水族、七虫族连同兽族的诡门，联手进攻熔海崖，却在寥廓熔城下吃了败仗。狐晏大怒，却察觉到古仙人之一的默提上人来到厚土界，惊惧之下，潜上悬空岛将法阵毁掉，断了厚土界同仙界的联系。同时，抢夺了九界道祖遗留的法器贝叶宝鼎，逃到了焚天坑，藏身于宝鼎之内。 厚土界暂时归于平静，可是平地再起波澜，大衍国出现内乱。南疆王叶衷尹勾结流千川，毒杀皇帝叶衷渔，并派人追杀皇太子叶长亭。幸得千灵族女祭司月颜相助，屡屡绝处逢生，反在紫竹潭附近，和凤羽族羽柔联手，将流千川格杀。接着，以叶衷尹和叶长亭为首的两派利益团体，在紫竹潭一带大打出手，死伤无算，是为横水血战。横水血战之后，双方均元气大伤，无力再战。此后，叶衷尹被皇后琴歌鸩杀，叶长亭得以回到浮云城，复又遭到暗杀，结果琴歌的重始宗弟子身份暴露，不得以以死谢罪。叶长亭心灰意冷，和月颜隐居在夕州忘忧湖畔。
十余年后，叶长亭和月颜的儿子叶无忧出世，叶无忧乃是仙界季贤坐化后投胎转世，又得藏于载月湖底的上仙紫枫真人传授修真法门，所以只用了短短二十多年，就已有了很高的境界。叶无忧受紫枫真人教导，游历天下。在冰沐原，出手击退御风族沙漫天，救下了重始宗女弟子纳兰。两人由此心生爱慕，可是面对厚土界纷乱的局面，叶无忧不愿受儿女情的束缚，不辞而别，在天堑山脉闭关九年悟道。出山后的叶无忧以玄元宗的名义，拯救黎民，被世人尊称为玄远道尊。纳兰得知叶无忧成为玄远道尊后，伤心之余隐居于冰沐原沐芳谷，潜心修行。
就在玄元宗风行天下之时，九界道祖撰写的《阴阳道鉴》生出灵念，化身成人，凭借其先天的博学，借重始宗的名义成为重始道尊，以铁血的方式横扫天下。重始宗和玄元宗不可避免地碰撞在一起，玄远道尊为苍生的安危，毅然赶赴重始宗，和重始道尊尽释前嫌，携手开创了玄明盛世。盛世数百年中，二位道尊尽力消除种族、门户之见，设法化解了栖绵族和诡门的恩怨，将凤羽族凤幽部落的亡灵禁制在曲堰谷和七杀回廊，又将蕴水族水倾湫拘禁于帘川，然后将野心勃勃的火连城打落沸浪池中，跟着用镇天罗将七虫族禁制在焚天坑内；大乱归于大治，各族百姓安居乐业。玄元、重始二位道尊安然飞升，成为九界坍塌以来，唯一能飞升仙界的修真者。
盛世之中，却仍有一群苦行者不肯就范，这些人大多是为保持自身修真传统，不甘于受玄元、重始二宗限制的修真者。而在他们的身后是一个神秘的势力，这股势力真正的首脑正是纳兰。纳兰由爱生恨，一直想证明叶无忧的选择是错误的。这些年来，虽然无法正面与玄元宗抗衡，但是她将所有对现状不满的苦行者一一收服，待机而动。后来，重始宗宗主海邀黎，因为对修仙之路心存疑惑，无奈之下居然向苦行者求教，纳兰意识到，苦苦等待的时机终于到来。
盛世末年，发生了一件对日后影响异常深远之事：焚天坑异象。焚天坑是当年玄元道尊禁制七虫族之地，如此异变自然惊动了整个厚土界。包括玄元、重始二宗在内的许多各大修真门派，纷纷派人前往此地，一查究竟，随后发生了诸多离奇的惨剧，终于引来了又一次乱世！
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